Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf6bO35451 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf6bO35451 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf6bO35451 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf6bO35451 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf6bO35451 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf6bO35451 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf6bO35451 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf6bO35451 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf6bO35451 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf6bO35451 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf6bO35451 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf6bO35451 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf6bO35451 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf6bO35451 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf6bO35451 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf6bO35451 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf6bO35451 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf6bO35451 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf6bO35451 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf6bO35451 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf6bO35451 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf6bO35451 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf6bO35451 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf6bO35451 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf6bO35451 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atf6bO35451 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atf6bO35451 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atf6bO35451 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf6bO35451 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atf6bO35451 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atf6bO35451 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atf6bO35451 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf6bO35451 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf6bO35451 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf6bO35451 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf6bO35451 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf6bO35451 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf6bO35451 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf6bO35451 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atf6bO35451 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf6bO35451 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf6bO35451 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf6bO35451 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf6bO35451 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf6bO35451 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf6bO35451 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf6bO35451 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf6bO35451 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atf6bO35451 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Atf6bO35451 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atf6bO35451 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf6bO35451 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf6bO35451 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf6bO35451 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf6bO35451 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf6bO35451 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf6bO35451 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf6bO35451 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atf6bO35451 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atf6bO35451 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf6bO35451 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf6bO35451 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf6bO35451 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf6bO35451 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf6bO35451 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf6bO35451 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf6bO35451 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf6bO35451 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf6bO35451 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf6bO35451 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf6bO35451 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf6bO35451 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf6bO35451 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf6bO35451 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf6bO35451 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf6bO35451 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf6bO35451 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf6bO35451 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf6bO35451 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf6bO35451 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf6bO35451 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf6bO35451 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf6bO35451 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atf6bO35451 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf6bO35451 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf6bO35451 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf6bO35451 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf6bO35451 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf6bO35451 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf6bO35451 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf6bO35451 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf6bO35451 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf6bO35451 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf6bO35451 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf6bO35451 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf6bO35451 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf6bO35451 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf6bO35451 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf6bO35451 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms