Protein–RNA interactions for Protein: O08792

Ebf2, Transcription factor COE2, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf2O08792 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ebf2O08792 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ebf2O08792 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ebf2O08792 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ebf2O08792 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ebf2O08792 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ebf2O08792 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ebf2O08792 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ebf2O08792 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ebf2O08792 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ebf2O08792 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ebf2O08792 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ebf2O08792 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ebf2O08792 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ebf2O08792 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ebf2O08792 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ebf2O08792 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ebf2O08792 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ebf2O08792 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ebf2O08792 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ebf2O08792 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ebf2O08792 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ebf2O08792 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ebf2O08792 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ebf2O08792 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ebf2O08792 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ebf2O08792 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ebf2O08792 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ebf2O08792 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ebf2O08792 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ebf2O08792 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ebf2O08792 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ebf2O08792 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ebf2O08792 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ebf2O08792 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ebf2O08792 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ebf2O08792 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ebf2O08792 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ebf2O08792 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ebf2O08792 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ebf2O08792 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ebf2O08792 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ebf2O08792 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ebf2O08792 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ebf2O08792 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ebf2O08792 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ebf2O08792 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ebf2O08792 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ebf2O08792 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ebf2O08792 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ebf2O08792 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ebf2O08792 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ebf2O08792 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ebf2O08792 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ebf2O08792 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ebf2O08792 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ebf2O08792 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ebf2O08792 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ebf2O08792 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ebf2O08792 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ebf2O08792 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ebf2O08792 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ebf2O08792 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ebf2O08792 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ebf2O08792 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ebf2O08792 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ebf2O08792 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ebf2O08792 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ebf2O08792 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ebf2O08792 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ebf2O08792 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ebf2O08792 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ebf2O08792 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ebf2O08792 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ebf2O08792 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ebf2O08792 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ebf2O08792 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ebf2O08792 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ebf2O08792 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ebf2O08792 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ebf2O08792 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ebf2O08792 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ebf2O08792 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ebf2O08792 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ebf2O08792 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ebf2O08792 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ebf2O08792 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ebf2O08792 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ebf2O08792 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ebf2O08792 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ebf2O08792 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ebf2O08792 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ebf2O08792 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ebf2O08792 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ebf2O08792 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ebf2O08792 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ebf2O08792 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ebf2O08792 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ebf2O08792 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ebf2O08792 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.7 ms