Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mfsd4b4J3QNS5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mfsd4b4J3QNS5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mfsd4b4J3QNS5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mfsd4b4J3QNS5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mfsd4b4J3QNS5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mfsd4b4J3QNS5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Mfsd4b4J3QNS5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mfsd4b4J3QNS5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mfsd4b4J3QNS5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mfsd4b4J3QNS5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mfsd4b4J3QNS5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mfsd4b4J3QNS5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mfsd4b4J3QNS5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mfsd4b4J3QNS5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mfsd4b4J3QNS5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mfsd4b4J3QNS5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mfsd4b4J3QNS5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mfsd4b4J3QNS5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Mfsd4b4J3QNS5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mfsd4b4J3QNS5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mfsd4b4J3QNS5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mfsd4b4J3QNS5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mfsd4b4J3QNS5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mfsd4b4J3QNS5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mfsd4b4J3QNS5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mfsd4b4J3QNS5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mfsd4b4J3QNS5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mfsd4b4J3QNS5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mfsd4b4J3QNS5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mfsd4b4J3QNS5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mfsd4b4J3QNS5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mfsd4b4J3QNS5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mfsd4b4J3QNS5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mfsd4b4J3QNS5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Mfsd4b4J3QNS5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mfsd4b4J3QNS5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mfsd4b4J3QNS5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mfsd4b4J3QNS5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mfsd4b4J3QNS5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mfsd4b4J3QNS5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mfsd4b4J3QNS5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mfsd4b4J3QNS5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mfsd4b4J3QNS5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mfsd4b4J3QNS5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mfsd4b4J3QNS5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mfsd4b4J3QNS5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mfsd4b4J3QNS5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mfsd4b4J3QNS5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mfsd4b4J3QNS5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mfsd4b4J3QNS5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mfsd4b4J3QNS5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mfsd4b4J3QNS5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mfsd4b4J3QNS5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mfsd4b4J3QNS5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mfsd4b4J3QNS5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mfsd4b4J3QNS5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mfsd4b4J3QNS5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mfsd4b4J3QNS5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mfsd4b4J3QNS5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Mfsd4b4J3QNS5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mfsd4b4J3QNS5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mfsd4b4J3QNS5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mfsd4b4J3QNS5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Mfsd4b4J3QNS5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mfsd4b4J3QNS5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mfsd4b4J3QNS5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mfsd4b4J3QNS5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mfsd4b4J3QNS5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mfsd4b4J3QNS5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mfsd4b4J3QNS5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mfsd4b4J3QNS5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mfsd4b4J3QNS5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mfsd4b4J3QNS5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mfsd4b4J3QNS5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mfsd4b4J3QNS5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mfsd4b4J3QNS5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mfsd4b4J3QNS5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mfsd4b4J3QNS5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mfsd4b4J3QNS5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mfsd4b4J3QNS5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mfsd4b4J3QNS5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mfsd4b4J3QNS5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms