Protein–RNA interactions for Protein: J3QMW9

Btbd35f6, BTB domain-containing 35, family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f6J3QMW9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Btbd35f6J3QMW9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Btbd35f6J3QMW9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Btbd35f6J3QMW9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Btbd35f6J3QMW9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Btbd35f6J3QMW9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Btbd35f6J3QMW9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Btbd35f6J3QMW9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Btbd35f6J3QMW9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Btbd35f6J3QMW9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Btbd35f6J3QMW9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Btbd35f6J3QMW9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Btbd35f6J3QMW9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Btbd35f6J3QMW9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Btbd35f6J3QMW9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Btbd35f6J3QMW9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Btbd35f6J3QMW9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Btbd35f6J3QMW9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Btbd35f6J3QMW9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Btbd35f6J3QMW9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Btbd35f6J3QMW9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Btbd35f6J3QMW9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Btbd35f6J3QMW9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Btbd35f6J3QMW9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Btbd35f6J3QMW9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Btbd35f6J3QMW9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Btbd35f6J3QMW9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Btbd35f6J3QMW9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Btbd35f6J3QMW9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Btbd35f6J3QMW9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Btbd35f6J3QMW9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Btbd35f6J3QMW9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Btbd35f6J3QMW9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Btbd35f6J3QMW9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Btbd35f6J3QMW9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Btbd35f6J3QMW9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Btbd35f6J3QMW9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Btbd35f6J3QMW9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Btbd35f6J3QMW9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Btbd35f6J3QMW9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Btbd35f6J3QMW9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Btbd35f6J3QMW9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Btbd35f6J3QMW9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Btbd35f6J3QMW9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Btbd35f6J3QMW9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Btbd35f6J3QMW9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Btbd35f6J3QMW9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Btbd35f6J3QMW9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Btbd35f6J3QMW9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Btbd35f6J3QMW9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Btbd35f6J3QMW9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Btbd35f6J3QMW9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Btbd35f6J3QMW9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Btbd35f6J3QMW9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Btbd35f6J3QMW9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Btbd35f6J3QMW9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Btbd35f6J3QMW9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Btbd35f6J3QMW9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Btbd35f6J3QMW9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Btbd35f6J3QMW9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Btbd35f6J3QMW9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Btbd35f6J3QMW9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Btbd35f6J3QMW9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Btbd35f6J3QMW9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Btbd35f6J3QMW9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Btbd35f6J3QMW9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Btbd35f6J3QMW9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Btbd35f6J3QMW9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Btbd35f6J3QMW9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Btbd35f6J3QMW9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Btbd35f6J3QMW9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Btbd35f6J3QMW9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Btbd35f6J3QMW9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Btbd35f6J3QMW9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Btbd35f6J3QMW9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Btbd35f6J3QMW9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Btbd35f6J3QMW9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Btbd35f6J3QMW9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Btbd35f6J3QMW9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Btbd35f6J3QMW9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Btbd35f6J3QMW9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Btbd35f6J3QMW9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Btbd35f6J3QMW9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Btbd35f6J3QMW9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Btbd35f6J3QMW9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Btbd35f6J3QMW9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Btbd35f6J3QMW9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Btbd35f6J3QMW9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Btbd35f6J3QMW9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Btbd35f6J3QMW9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Btbd35f6J3QMW9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Btbd35f6J3QMW9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Btbd35f6J3QMW9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Btbd35f6J3QMW9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Btbd35f6J3QMW9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Btbd35f6J3QMW9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Btbd35f6J3QMW9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Btbd35f6J3QMW9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Btbd35f6J3QMW9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Btbd35f6J3QMW9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms