Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Plekhg1F6S200 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Plekhg1F6S200 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Plekhg1F6S200 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Plekhg1F6S200 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
Plekhg1F6S200 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Plekhg1F6S200 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Plekhg1F6S200 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Plekhg1F6S200 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Plekhg1F6S200 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Plekhg1F6S200 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Plekhg1F6S200 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Plekhg1F6S200 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Plekhg1F6S200 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Plekhg1F6S200 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Plekhg1F6S200 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
Plekhg1F6S200 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Plekhg1F6S200 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Plekhg1F6S200 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Plekhg1F6S200 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Plekhg1F6S200 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Plekhg1F6S200 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Plekhg1F6S200 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Plekhg1F6S200 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Plekhg1F6S200 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Plekhg1F6S200 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Plekhg1F6S200 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Plekhg1F6S200 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Plekhg1F6S200 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Plekhg1F6S200 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Plekhg1F6S200 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Plekhg1F6S200 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Plekhg1F6S200 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Plekhg1F6S200 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Plekhg1F6S200 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Plekhg1F6S200 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Plekhg1F6S200 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Plekhg1F6S200 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Plekhg1F6S200 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Plekhg1F6S200 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Plekhg1F6S200 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Plekhg1F6S200 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Plekhg1F6S200 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Plekhg1F6S200 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Plekhg1F6S200 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Plekhg1F6S200 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Plekhg1F6S200 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Plekhg1F6S200 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Plekhg1F6S200 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Plekhg1F6S200 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Plekhg1F6S200 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Plekhg1F6S200 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Plekhg1F6S200 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Plekhg1F6S200 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Plekhg1F6S200 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Plekhg1F6S200 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Plekhg1F6S200 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Plekhg1F6S200 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Plekhg1F6S200 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Plekhg1F6S200 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Plekhg1F6S200 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Plekhg1F6S200 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Plekhg1F6S200 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Plekhg1F6S200 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Plekhg1F6S200 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Plekhg1F6S200 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Plekhg1F6S200 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Plekhg1F6S200 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Plekhg1F6S200 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Plekhg1F6S200 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.61
Plekhg1F6S200 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Plekhg1F6S200 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Plekhg1F6S200 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Plekhg1F6S200 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Plekhg1F6S200 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Plekhg1F6S200 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Plekhg1F6S200 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Plekhg1F6S200 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Plekhg1F6S200 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Plekhg1F6S200 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Plekhg1F6S200 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Plekhg1F6S200 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Plekhg1F6S200 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Plekhg1F6S200 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Plekhg1F6S200 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Plekhg1F6S200 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Plekhg1F6S200 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Plekhg1F6S200 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Plekhg1F6S200 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Plekhg1F6S200 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Plekhg1F6S200 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Plekhg1F6S200 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Plekhg1F6S200 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Plekhg1F6S200 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Plekhg1F6S200 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Plekhg1F6S200 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Plekhg1F6S200 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Plekhg1F6S200 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Plekhg1F6S200 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Plekhg1F6S200 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms