Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
Erich3F6QRE9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
Erich3F6QRE9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
Erich3F6QRE9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Erich3F6QRE9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
Erich3F6QRE9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Erich3F6QRE9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Erich3F6QRE9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
Erich3F6QRE9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Erich3F6QRE9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Erich3F6QRE9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Erich3F6QRE9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Erich3F6QRE9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Erich3F6QRE9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
Erich3F6QRE9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Erich3F6QRE9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Erich3F6QRE9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
Erich3F6QRE9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.58
Erich3F6QRE9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
Erich3F6QRE9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Erich3F6QRE9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Erich3F6QRE9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Erich3F6QRE9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
Erich3F6QRE9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Erich3F6QRE9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Erich3F6QRE9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Erich3F6QRE9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Erich3F6QRE9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
Erich3F6QRE9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Erich3F6QRE9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Erich3F6QRE9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC43.3■■■■■ 4.52
Erich3F6QRE9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Erich3F6QRE9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Erich3F6QRE9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
Erich3F6QRE9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Erich3F6QRE9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Erich3F6QRE9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.51
Erich3F6QRE9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Erich3F6QRE9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
Erich3F6QRE9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
Erich3F6QRE9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Erich3F6QRE9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Erich3F6QRE9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Erich3F6QRE9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
Erich3F6QRE9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Erich3F6QRE9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
Erich3F6QRE9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Erich3F6QRE9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Erich3F6QRE9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC42.87■■■■■ 4.45
Erich3F6QRE9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Erich3F6QRE9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Erich3F6QRE9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Erich3F6QRE9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Erich3F6QRE9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Erich3F6QRE9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC42.68■■■■■ 4.42
Erich3F6QRE9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
Erich3F6QRE9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Erich3F6QRE9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Erich3F6QRE9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Erich3F6QRE9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Erich3F6QRE9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Erich3F6QRE9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
Erich3F6QRE9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Erich3F6QRE9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Erich3F6QRE9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Erich3F6QRE9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
Erich3F6QRE9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
Erich3F6QRE9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
Erich3F6QRE9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Erich3F6QRE9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Erich3F6QRE9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Erich3F6QRE9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Erich3F6QRE9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Erich3F6QRE9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Erich3F6QRE9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Erich3F6QRE9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Erich3F6QRE9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Erich3F6QRE9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Erich3F6QRE9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Erich3F6QRE9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Erich3F6QRE9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Erich3F6QRE9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Erich3F6QRE9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC42.01■■■■■ 4.32
Erich3F6QRE9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC42■■■■■ 4.31
Erich3F6QRE9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Erich3F6QRE9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Erich3F6QRE9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Erich3F6QRE9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Erich3F6QRE9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Erich3F6QRE9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Erich3F6QRE9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
Erich3F6QRE9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Erich3F6QRE9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Erich3F6QRE9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Erich3F6QRE9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
Erich3F6QRE9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
Erich3F6QRE9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Erich3F6QRE9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Erich3F6QRE9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
Erich3F6QRE9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms