Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Pik3c2bE9QAN8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Pik3c2bE9QAN8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Pik3c2bE9QAN8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Pik3c2bE9QAN8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Pik3c2bE9QAN8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Pik3c2bE9QAN8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Pik3c2bE9QAN8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Pik3c2bE9QAN8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Pik3c2bE9QAN8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Pik3c2bE9QAN8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Pik3c2bE9QAN8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Pik3c2bE9QAN8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Pik3c2bE9QAN8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Pik3c2bE9QAN8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Pik3c2bE9QAN8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Pik3c2bE9QAN8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Pik3c2bE9QAN8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Pik3c2bE9QAN8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
Pik3c2bE9QAN8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Pik3c2bE9QAN8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Pik3c2bE9QAN8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Pik3c2bE9QAN8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
Pik3c2bE9QAN8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Pik3c2bE9QAN8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Pik3c2bE9QAN8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Pik3c2bE9QAN8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Pik3c2bE9QAN8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Pik3c2bE9QAN8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Pik3c2bE9QAN8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Pik3c2bE9QAN8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Pik3c2bE9QAN8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Pik3c2bE9QAN8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Pik3c2bE9QAN8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Pik3c2bE9QAN8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Pik3c2bE9QAN8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Pik3c2bE9QAN8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Pik3c2bE9QAN8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Pik3c2bE9QAN8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Pik3c2bE9QAN8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Pik3c2bE9QAN8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Pik3c2bE9QAN8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Pik3c2bE9QAN8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Pik3c2bE9QAN8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Pik3c2bE9QAN8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Pik3c2bE9QAN8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Pik3c2bE9QAN8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Pik3c2bE9QAN8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Pik3c2bE9QAN8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Pik3c2bE9QAN8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Pik3c2bE9QAN8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Pik3c2bE9QAN8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Pik3c2bE9QAN8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Pik3c2bE9QAN8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Pik3c2bE9QAN8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Pik3c2bE9QAN8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Pik3c2bE9QAN8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Pik3c2bE9QAN8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Pik3c2bE9QAN8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Pik3c2bE9QAN8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Pik3c2bE9QAN8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Pik3c2bE9QAN8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Pik3c2bE9QAN8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Pik3c2bE9QAN8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Pik3c2bE9QAN8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Pik3c2bE9QAN8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Pik3c2bE9QAN8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Pik3c2bE9QAN8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Pik3c2bE9QAN8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Pik3c2bE9QAN8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Pik3c2bE9QAN8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Pik3c2bE9QAN8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Pik3c2bE9QAN8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Pik3c2bE9QAN8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Pik3c2bE9QAN8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Pik3c2bE9QAN8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Pik3c2bE9QAN8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Pik3c2bE9QAN8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Pik3c2bE9QAN8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Pik3c2bE9QAN8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Pik3c2bE9QAN8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Pik3c2bE9QAN8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Pik3c2bE9QAN8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Pik3c2bE9QAN8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Pik3c2bE9QAN8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Pik3c2bE9QAN8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Pik3c2bE9QAN8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Pik3c2bE9QAN8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Pik3c2bE9QAN8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Pik3c2bE9QAN8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Pik3c2bE9QAN8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Pik3c2bE9QAN8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Pik3c2bE9QAN8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Pik3c2bE9QAN8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Pik3c2bE9QAN8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Pik3c2bE9QAN8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Pik3c2bE9QAN8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Pik3c2bE9QAN8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Pik3c2bE9QAN8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Pik3c2bE9QAN8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms