Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Usp31E9Q6Y8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Usp31E9Q6Y8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Usp31E9Q6Y8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Usp31E9Q6Y8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Usp31E9Q6Y8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Usp31E9Q6Y8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Usp31E9Q6Y8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Usp31E9Q6Y8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Usp31E9Q6Y8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Usp31E9Q6Y8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Usp31E9Q6Y8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Usp31E9Q6Y8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Usp31E9Q6Y8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Usp31E9Q6Y8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Usp31E9Q6Y8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Usp31E9Q6Y8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Usp31E9Q6Y8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Usp31E9Q6Y8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Usp31E9Q6Y8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Usp31E9Q6Y8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Usp31E9Q6Y8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Usp31E9Q6Y8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Usp31E9Q6Y8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Usp31E9Q6Y8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Usp31E9Q6Y8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Usp31E9Q6Y8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Usp31E9Q6Y8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Usp31E9Q6Y8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Usp31E9Q6Y8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Usp31E9Q6Y8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Usp31E9Q6Y8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Usp31E9Q6Y8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Usp31E9Q6Y8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Usp31E9Q6Y8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Usp31E9Q6Y8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Usp31E9Q6Y8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Usp31E9Q6Y8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Usp31E9Q6Y8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Usp31E9Q6Y8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Usp31E9Q6Y8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Usp31E9Q6Y8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Usp31E9Q6Y8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Usp31E9Q6Y8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Usp31E9Q6Y8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Usp31E9Q6Y8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Usp31E9Q6Y8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Usp31E9Q6Y8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Usp31E9Q6Y8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Usp31E9Q6Y8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Usp31E9Q6Y8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Usp31E9Q6Y8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Usp31E9Q6Y8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Usp31E9Q6Y8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Usp31E9Q6Y8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Usp31E9Q6Y8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Usp31E9Q6Y8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Usp31E9Q6Y8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Usp31E9Q6Y8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Usp31E9Q6Y8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Usp31E9Q6Y8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Usp31E9Q6Y8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Usp31E9Q6Y8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Usp31E9Q6Y8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Usp31E9Q6Y8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Usp31E9Q6Y8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Usp31E9Q6Y8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Usp31E9Q6Y8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Usp31E9Q6Y8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Usp31E9Q6Y8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Usp31E9Q6Y8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Usp31E9Q6Y8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Usp31E9Q6Y8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Usp31E9Q6Y8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Usp31E9Q6Y8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp31E9Q6Y8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp31E9Q6Y8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Usp31E9Q6Y8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Usp31E9Q6Y8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Usp31E9Q6Y8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Usp31E9Q6Y8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Usp31E9Q6Y8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Usp31E9Q6Y8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Usp31E9Q6Y8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Usp31E9Q6Y8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Usp31E9Q6Y8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Usp31E9Q6Y8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Usp31E9Q6Y8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Usp31E9Q6Y8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Usp31E9Q6Y8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Usp31E9Q6Y8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Usp31E9Q6Y8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Usp31E9Q6Y8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Usp31E9Q6Y8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Usp31E9Q6Y8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Usp31E9Q6Y8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Usp31E9Q6Y8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Usp31E9Q6Y8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Usp31E9Q6Y8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms