Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DspE9Q557 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DspE9Q557 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DspE9Q557 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DspE9Q557 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DspE9Q557 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DspE9Q557 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DspE9Q557 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DspE9Q557 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DspE9Q557 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DspE9Q557 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DspE9Q557 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DspE9Q557 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DspE9Q557 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DspE9Q557 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DspE9Q557 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DspE9Q557 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DspE9Q557 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DspE9Q557 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DspE9Q557 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DspE9Q557 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DspE9Q557 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DspE9Q557 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DspE9Q557 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DspE9Q557 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DspE9Q557 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DspE9Q557 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DspE9Q557 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DspE9Q557 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DspE9Q557 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DspE9Q557 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DspE9Q557 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DspE9Q557 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DspE9Q557 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DspE9Q557 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DspE9Q557 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DspE9Q557 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DspE9Q557 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DspE9Q557 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DspE9Q557 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DspE9Q557 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DspE9Q557 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DspE9Q557 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DspE9Q557 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DspE9Q557 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DspE9Q557 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DspE9Q557 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DspE9Q557 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DspE9Q557 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DspE9Q557 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DspE9Q557 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DspE9Q557 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DspE9Q557 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DspE9Q557 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DspE9Q557 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DspE9Q557 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DspE9Q557 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DspE9Q557 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DspE9Q557 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DspE9Q557 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DspE9Q557 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DspE9Q557 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DspE9Q557 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DspE9Q557 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DspE9Q557 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DspE9Q557 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DspE9Q557 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DspE9Q557 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DspE9Q557 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DspE9Q557 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DspE9Q557 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DspE9Q557 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DspE9Q557 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DspE9Q557 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DspE9Q557 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DspE9Q557 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DspE9Q557 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DspE9Q557 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DspE9Q557 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DspE9Q557 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DspE9Q557 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DspE9Q557 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DspE9Q557 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DspE9Q557 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DspE9Q557 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DspE9Q557 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DspE9Q557 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DspE9Q557 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DspE9Q557 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
DspE9Q557 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DspE9Q557 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DspE9Q557 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DspE9Q557 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DspE9Q557 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DspE9Q557 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DspE9Q557 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DspE9Q557 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DspE9Q557 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DspE9Q557 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DspE9Q557 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms