Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
4930579F01RikE9Q3L6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930579F01RikE9Q3L6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930579F01RikE9Q3L6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930579F01RikE9Q3L6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
4930579F01RikE9Q3L6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930579F01RikE9Q3L6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930579F01RikE9Q3L6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930579F01RikE9Q3L6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930579F01RikE9Q3L6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
4930579F01RikE9Q3L6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930579F01RikE9Q3L6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930579F01RikE9Q3L6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930579F01RikE9Q3L6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930579F01RikE9Q3L6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930579F01RikE9Q3L6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930579F01RikE9Q3L6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930579F01RikE9Q3L6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930579F01RikE9Q3L6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
4930579F01RikE9Q3L6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930579F01RikE9Q3L6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930579F01RikE9Q3L6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930579F01RikE9Q3L6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930579F01RikE9Q3L6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930579F01RikE9Q3L6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930579F01RikE9Q3L6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930579F01RikE9Q3L6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930579F01RikE9Q3L6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
4930579F01RikE9Q3L6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930579F01RikE9Q3L6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930579F01RikE9Q3L6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930579F01RikE9Q3L6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930579F01RikE9Q3L6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930579F01RikE9Q3L6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930579F01RikE9Q3L6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930579F01RikE9Q3L6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930579F01RikE9Q3L6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930579F01RikE9Q3L6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930579F01RikE9Q3L6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930579F01RikE9Q3L6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
4930579F01RikE9Q3L6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930579F01RikE9Q3L6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930579F01RikE9Q3L6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930579F01RikE9Q3L6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930579F01RikE9Q3L6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930579F01RikE9Q3L6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
4930579F01RikE9Q3L6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
4930579F01RikE9Q3L6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930579F01RikE9Q3L6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930579F01RikE9Q3L6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930579F01RikE9Q3L6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930579F01RikE9Q3L6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930579F01RikE9Q3L6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930579F01RikE9Q3L6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930579F01RikE9Q3L6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930579F01RikE9Q3L6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930579F01RikE9Q3L6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
4930579F01RikE9Q3L6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930579F01RikE9Q3L6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930579F01RikE9Q3L6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930579F01RikE9Q3L6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930579F01RikE9Q3L6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930579F01RikE9Q3L6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930579F01RikE9Q3L6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930579F01RikE9Q3L6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930579F01RikE9Q3L6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
4930579F01RikE9Q3L6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930579F01RikE9Q3L6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930579F01RikE9Q3L6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930579F01RikE9Q3L6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930579F01RikE9Q3L6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930579F01RikE9Q3L6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930579F01RikE9Q3L6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
4930579F01RikE9Q3L6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930579F01RikE9Q3L6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930579F01RikE9Q3L6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930579F01RikE9Q3L6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930579F01RikE9Q3L6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930579F01RikE9Q3L6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930579F01RikE9Q3L6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930579F01RikE9Q3L6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930579F01RikE9Q3L6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930579F01RikE9Q3L6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms