Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NebE9Q1W3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NebE9Q1W3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NebE9Q1W3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
NebE9Q1W3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
NebE9Q1W3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
NebE9Q1W3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms