Protein–RNA interactions for Protein: D3Z623

9330159F19Rik, MCG7194, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330159F19RikD3Z623 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
9330159F19RikD3Z623 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
9330159F19RikD3Z623 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
9330159F19RikD3Z623 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
9330159F19RikD3Z623 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
9330159F19RikD3Z623 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
9330159F19RikD3Z623 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
9330159F19RikD3Z623 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
9330159F19RikD3Z623 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
9330159F19RikD3Z623 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
9330159F19RikD3Z623 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
9330159F19RikD3Z623 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
9330159F19RikD3Z623 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
9330159F19RikD3Z623 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
9330159F19RikD3Z623 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
9330159F19RikD3Z623 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
9330159F19RikD3Z623 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
9330159F19RikD3Z623 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
9330159F19RikD3Z623 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
9330159F19RikD3Z623 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
9330159F19RikD3Z623 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
9330159F19RikD3Z623 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
9330159F19RikD3Z623 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
9330159F19RikD3Z623 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
9330159F19RikD3Z623 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
9330159F19RikD3Z623 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
9330159F19RikD3Z623 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
9330159F19RikD3Z623 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
9330159F19RikD3Z623 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
9330159F19RikD3Z623 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
9330159F19RikD3Z623 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
9330159F19RikD3Z623 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
9330159F19RikD3Z623 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
9330159F19RikD3Z623 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
9330159F19RikD3Z623 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
9330159F19RikD3Z623 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
9330159F19RikD3Z623 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
9330159F19RikD3Z623 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
9330159F19RikD3Z623 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
9330159F19RikD3Z623 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
9330159F19RikD3Z623 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
9330159F19RikD3Z623 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
9330159F19RikD3Z623 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
9330159F19RikD3Z623 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
9330159F19RikD3Z623 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
9330159F19RikD3Z623 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
9330159F19RikD3Z623 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
9330159F19RikD3Z623 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
9330159F19RikD3Z623 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
9330159F19RikD3Z623 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
9330159F19RikD3Z623 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
9330159F19RikD3Z623 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
9330159F19RikD3Z623 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
9330159F19RikD3Z623 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
9330159F19RikD3Z623 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
9330159F19RikD3Z623 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
9330159F19RikD3Z623 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
9330159F19RikD3Z623 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
9330159F19RikD3Z623 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
9330159F19RikD3Z623 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
9330159F19RikD3Z623 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
9330159F19RikD3Z623 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
9330159F19RikD3Z623 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
9330159F19RikD3Z623 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
9330159F19RikD3Z623 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
9330159F19RikD3Z623 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
9330159F19RikD3Z623 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
9330159F19RikD3Z623 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
9330159F19RikD3Z623 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
9330159F19RikD3Z623 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
9330159F19RikD3Z623 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
9330159F19RikD3Z623 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
9330159F19RikD3Z623 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
9330159F19RikD3Z623 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
9330159F19RikD3Z623 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
9330159F19RikD3Z623 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
9330159F19RikD3Z623 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
9330159F19RikD3Z623 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
9330159F19RikD3Z623 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
9330159F19RikD3Z623 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
9330159F19RikD3Z623 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
9330159F19RikD3Z623 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
9330159F19RikD3Z623 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
9330159F19RikD3Z623 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
9330159F19RikD3Z623 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
9330159F19RikD3Z623 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
9330159F19RikD3Z623 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
9330159F19RikD3Z623 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
9330159F19RikD3Z623 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
9330159F19RikD3Z623 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
9330159F19RikD3Z623 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
9330159F19RikD3Z623 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
9330159F19RikD3Z623 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
9330159F19RikD3Z623 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
9330159F19RikD3Z623 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
9330159F19RikD3Z623 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
9330159F19RikD3Z623 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
9330159F19RikD3Z623 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
9330159F19RikD3Z623 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
9330159F19RikD3Z623 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms