Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

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Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx6-2D3Z4R4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx6-2D3Z4R4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx6-2D3Z4R4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx6-2D3Z4R4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx6-2D3Z4R4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx6-2D3Z4R4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx6-2D3Z4R4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx6-2D3Z4R4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx6-2D3Z4R4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx6-2D3Z4R4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx6-2D3Z4R4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx6-2D3Z4R4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx6-2D3Z4R4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx6-2D3Z4R4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx6-2D3Z4R4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx6-2D3Z4R4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx6-2D3Z4R4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx6-2D3Z4R4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx6-2D3Z4R4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx6-2D3Z4R4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx6-2D3Z4R4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx6-2D3Z4R4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx6-2D3Z4R4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx6-2D3Z4R4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx6-2D3Z4R4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx6-2D3Z4R4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx6-2D3Z4R4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nkx6-2D3Z4R4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx6-2D3Z4R4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx6-2D3Z4R4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx6-2D3Z4R4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx6-2D3Z4R4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx6-2D3Z4R4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx6-2D3Z4R4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx6-2D3Z4R4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx6-2D3Z4R4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx6-2D3Z4R4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx6-2D3Z4R4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx6-2D3Z4R4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx6-2D3Z4R4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx6-2D3Z4R4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx6-2D3Z4R4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx6-2D3Z4R4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx6-2D3Z4R4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx6-2D3Z4R4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx6-2D3Z4R4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx6-2D3Z4R4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx6-2D3Z4R4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx6-2D3Z4R4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx6-2D3Z4R4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx6-2D3Z4R4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx6-2D3Z4R4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx6-2D3Z4R4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx6-2D3Z4R4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx6-2D3Z4R4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx6-2D3Z4R4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx6-2D3Z4R4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx6-2D3Z4R4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx6-2D3Z4R4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx6-2D3Z4R4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx6-2D3Z4R4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx6-2D3Z4R4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx6-2D3Z4R4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx6-2D3Z4R4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx6-2D3Z4R4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx6-2D3Z4R4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx6-2D3Z4R4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx6-2D3Z4R4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx6-2D3Z4R4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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