Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930467E23RikD3Z1P8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930467E23RikD3Z1P8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930467E23RikD3Z1P8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930467E23RikD3Z1P8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930467E23RikD3Z1P8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930467E23RikD3Z1P8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
4930467E23RikD3Z1P8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930467E23RikD3Z1P8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930467E23RikD3Z1P8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930467E23RikD3Z1P8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930467E23RikD3Z1P8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930467E23RikD3Z1P8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930467E23RikD3Z1P8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930467E23RikD3Z1P8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930467E23RikD3Z1P8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930467E23RikD3Z1P8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930467E23RikD3Z1P8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930467E23RikD3Z1P8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930467E23RikD3Z1P8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930467E23RikD3Z1P8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930467E23RikD3Z1P8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930467E23RikD3Z1P8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930467E23RikD3Z1P8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930467E23RikD3Z1P8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930467E23RikD3Z1P8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930467E23RikD3Z1P8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930467E23RikD3Z1P8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930467E23RikD3Z1P8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930467E23RikD3Z1P8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930467E23RikD3Z1P8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930467E23RikD3Z1P8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930467E23RikD3Z1P8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930467E23RikD3Z1P8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930467E23RikD3Z1P8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
4930467E23RikD3Z1P8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930467E23RikD3Z1P8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930467E23RikD3Z1P8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930467E23RikD3Z1P8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930467E23RikD3Z1P8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930467E23RikD3Z1P8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930467E23RikD3Z1P8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930467E23RikD3Z1P8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930467E23RikD3Z1P8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930467E23RikD3Z1P8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930467E23RikD3Z1P8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930467E23RikD3Z1P8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
4930467E23RikD3Z1P8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930467E23RikD3Z1P8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930467E23RikD3Z1P8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930467E23RikD3Z1P8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930467E23RikD3Z1P8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930467E23RikD3Z1P8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4930467E23RikD3Z1P8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930467E23RikD3Z1P8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930467E23RikD3Z1P8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930467E23RikD3Z1P8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930467E23RikD3Z1P8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930467E23RikD3Z1P8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930467E23RikD3Z1P8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
4930467E23RikD3Z1P8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930467E23RikD3Z1P8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930467E23RikD3Z1P8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930467E23RikD3Z1P8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930467E23RikD3Z1P8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
4930467E23RikD3Z1P8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930467E23RikD3Z1P8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930467E23RikD3Z1P8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930467E23RikD3Z1P8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930467E23RikD3Z1P8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930467E23RikD3Z1P8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930467E23RikD3Z1P8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930467E23RikD3Z1P8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930467E23RikD3Z1P8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930467E23RikD3Z1P8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930467E23RikD3Z1P8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930467E23RikD3Z1P8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
4930467E23RikD3Z1P8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930467E23RikD3Z1P8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930467E23RikD3Z1P8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930467E23RikD3Z1P8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930467E23RikD3Z1P8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
4930467E23RikD3Z1P8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms