Protein–RNA interactions for Protein: D3YWJ0

Nuggc, Nuclear GTPase SLIP-GC, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NuggcD3YWJ0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NuggcD3YWJ0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NuggcD3YWJ0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NuggcD3YWJ0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NuggcD3YWJ0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NuggcD3YWJ0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NuggcD3YWJ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NuggcD3YWJ0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NuggcD3YWJ0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NuggcD3YWJ0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NuggcD3YWJ0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NuggcD3YWJ0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NuggcD3YWJ0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NuggcD3YWJ0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NuggcD3YWJ0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NuggcD3YWJ0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NuggcD3YWJ0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NuggcD3YWJ0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NuggcD3YWJ0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NuggcD3YWJ0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NuggcD3YWJ0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NuggcD3YWJ0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NuggcD3YWJ0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NuggcD3YWJ0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NuggcD3YWJ0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NuggcD3YWJ0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NuggcD3YWJ0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NuggcD3YWJ0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NuggcD3YWJ0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NuggcD3YWJ0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NuggcD3YWJ0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NuggcD3YWJ0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NuggcD3YWJ0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NuggcD3YWJ0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NuggcD3YWJ0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NuggcD3YWJ0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NuggcD3YWJ0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NuggcD3YWJ0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NuggcD3YWJ0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NuggcD3YWJ0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NuggcD3YWJ0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NuggcD3YWJ0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NuggcD3YWJ0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NuggcD3YWJ0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NuggcD3YWJ0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NuggcD3YWJ0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NuggcD3YWJ0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NuggcD3YWJ0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NuggcD3YWJ0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NuggcD3YWJ0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NuggcD3YWJ0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NuggcD3YWJ0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NuggcD3YWJ0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NuggcD3YWJ0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NuggcD3YWJ0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NuggcD3YWJ0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NuggcD3YWJ0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NuggcD3YWJ0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NuggcD3YWJ0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NuggcD3YWJ0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NuggcD3YWJ0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NuggcD3YWJ0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NuggcD3YWJ0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NuggcD3YWJ0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NuggcD3YWJ0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NuggcD3YWJ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NuggcD3YWJ0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NuggcD3YWJ0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NuggcD3YWJ0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NuggcD3YWJ0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NuggcD3YWJ0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NuggcD3YWJ0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NuggcD3YWJ0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NuggcD3YWJ0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NuggcD3YWJ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NuggcD3YWJ0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NuggcD3YWJ0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NuggcD3YWJ0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NuggcD3YWJ0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NuggcD3YWJ0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NuggcD3YWJ0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NuggcD3YWJ0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NuggcD3YWJ0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NuggcD3YWJ0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NuggcD3YWJ0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NuggcD3YWJ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NuggcD3YWJ0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NuggcD3YWJ0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NuggcD3YWJ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NuggcD3YWJ0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NuggcD3YWJ0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NuggcD3YWJ0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NuggcD3YWJ0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NuggcD3YWJ0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NuggcD3YWJ0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NuggcD3YWJ0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NuggcD3YWJ0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NuggcD3YWJ0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NuggcD3YWJ0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NuggcD3YWJ0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms