Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rexo5D3YW29 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Rexo5D3YW29 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rexo5D3YW29 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rexo5D3YW29 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rexo5D3YW29 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rexo5D3YW29 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Rexo5D3YW29 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rexo5D3YW29 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Rexo5D3YW29 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rexo5D3YW29 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rexo5D3YW29 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rexo5D3YW29 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rexo5D3YW29 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rexo5D3YW29 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rexo5D3YW29 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Rexo5D3YW29 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rexo5D3YW29 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rexo5D3YW29 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rexo5D3YW29 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rexo5D3YW29 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rexo5D3YW29 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rexo5D3YW29 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rexo5D3YW29 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Rexo5D3YW29 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rexo5D3YW29 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rexo5D3YW29 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rexo5D3YW29 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rexo5D3YW29 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rexo5D3YW29 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rexo5D3YW29 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rexo5D3YW29 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rexo5D3YW29 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rexo5D3YW29 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rexo5D3YW29 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rexo5D3YW29 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rexo5D3YW29 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rexo5D3YW29 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rexo5D3YW29 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Rexo5D3YW29 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rexo5D3YW29 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rexo5D3YW29 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Rexo5D3YW29 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rexo5D3YW29 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rexo5D3YW29 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Rexo5D3YW29 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rexo5D3YW29 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rexo5D3YW29 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rexo5D3YW29 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rexo5D3YW29 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rexo5D3YW29 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rexo5D3YW29 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rexo5D3YW29 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rexo5D3YW29 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rexo5D3YW29 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rexo5D3YW29 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rexo5D3YW29 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rexo5D3YW29 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rexo5D3YW29 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rexo5D3YW29 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rexo5D3YW29 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rexo5D3YW29 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rexo5D3YW29 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Rexo5D3YW29 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rexo5D3YW29 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rexo5D3YW29 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
Rexo5D3YW29 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rexo5D3YW29 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rexo5D3YW29 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rexo5D3YW29 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rexo5D3YW29 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rexo5D3YW29 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rexo5D3YW29 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rexo5D3YW29 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rexo5D3YW29 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rexo5D3YW29 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rexo5D3YW29 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rexo5D3YW29 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rexo5D3YW29 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rexo5D3YW29 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Rexo5D3YW29 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rexo5D3YW29 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rexo5D3YW29 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rexo5D3YW29 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Rexo5D3YW29 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rexo5D3YW29 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rexo5D3YW29 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Rexo5D3YW29 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rexo5D3YW29 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Rexo5D3YW29 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rexo5D3YW29 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rexo5D3YW29 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Rexo5D3YW29 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rexo5D3YW29 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Rexo5D3YW29 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rexo5D3YW29 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rexo5D3YW29 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rexo5D3YW29 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rexo5D3YW29 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Rexo5D3YW29 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms