Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hbb-bh2B2RVB7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hbb-bh2B2RVB7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hbb-bh2B2RVB7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hbb-bh2B2RVB7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hbb-bh2B2RVB7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hbb-bh2B2RVB7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hbb-bh2B2RVB7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hbb-bh2B2RVB7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hbb-bh2B2RVB7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hbb-bh2B2RVB7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hbb-bh2B2RVB7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hbb-bh2B2RVB7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hbb-bh2B2RVB7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hbb-bh2B2RVB7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hbb-bh2B2RVB7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hbb-bh2B2RVB7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hbb-bh2B2RVB7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hbb-bh2B2RVB7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hbb-bh2B2RVB7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hbb-bh2B2RVB7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hbb-bh2B2RVB7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hbb-bh2B2RVB7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hbb-bh2B2RVB7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hbb-bh2B2RVB7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hbb-bh2B2RVB7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hbb-bh2B2RVB7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hbb-bh2B2RVB7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hbb-bh2B2RVB7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hbb-bh2B2RVB7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hbb-bh2B2RVB7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hbb-bh2B2RVB7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hbb-bh2B2RVB7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hbb-bh2B2RVB7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hbb-bh2B2RVB7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hbb-bh2B2RVB7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hbb-bh2B2RVB7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hbb-bh2B2RVB7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hbb-bh2B2RVB7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hbb-bh2B2RVB7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hbb-bh2B2RVB7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hbb-bh2B2RVB7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hbb-bh2B2RVB7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hbb-bh2B2RVB7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hbb-bh2B2RVB7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hbb-bh2B2RVB7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hbb-bh2B2RVB7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hbb-bh2B2RVB7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hbb-bh2B2RVB7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hbb-bh2B2RVB7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hbb-bh2B2RVB7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hbb-bh2B2RVB7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hbb-bh2B2RVB7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hbb-bh2B2RVB7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hbb-bh2B2RVB7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hbb-bh2B2RVB7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hbb-bh2B2RVB7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hbb-bh2B2RVB7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hbb-bh2B2RVB7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hbb-bh2B2RVB7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hbb-bh2B2RVB7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hbb-bh2B2RVB7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hbb-bh2B2RVB7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hbb-bh2B2RVB7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hbb-bh2B2RVB7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hbb-bh2B2RVB7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hbb-bh2B2RVB7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hbb-bh2B2RVB7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hbb-bh2B2RVB7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hbb-bh2B2RVB7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hbb-bh2B2RVB7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hbb-bh2B2RVB7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hbb-bh2B2RVB7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hbb-bh2B2RVB7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hbb-bh2B2RVB7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hbb-bh2B2RVB7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hbb-bh2B2RVB7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hbb-bh2B2RVB7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hbb-bh2B2RVB7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hbb-bh2B2RVB7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hbb-bh2B2RVB7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hbb-bh2B2RVB7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hbb-bh2B2RVB7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hbb-bh2B2RVB7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hbb-bh2B2RVB7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hbb-bh2B2RVB7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms