Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gm5483B2RV77 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gm5483B2RV77 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gm5483B2RV77 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gm5483B2RV77 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gm5483B2RV77 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gm5483B2RV77 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gm5483B2RV77 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gm5483B2RV77 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm5483B2RV77 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm5483B2RV77 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gm5483B2RV77 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gm5483B2RV77 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm5483B2RV77 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm5483B2RV77 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm5483B2RV77 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gm5483B2RV77 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm5483B2RV77 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm5483B2RV77 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gm5483B2RV77 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gm5483B2RV77 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm5483B2RV77 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm5483B2RV77 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm5483B2RV77 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm5483B2RV77 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm5483B2RV77 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm5483B2RV77 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm5483B2RV77 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm5483B2RV77 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gm5483B2RV77 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm5483B2RV77 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm5483B2RV77 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gm5483B2RV77 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm5483B2RV77 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm5483B2RV77 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gm5483B2RV77 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gm5483B2RV77 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gm5483B2RV77 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm5483B2RV77 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm5483B2RV77 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm5483B2RV77 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Gm5483B2RV77 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gm5483B2RV77 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm5483B2RV77 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gm5483B2RV77 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gm5483B2RV77 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm5483B2RV77 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm5483B2RV77 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm5483B2RV77 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm5483B2RV77 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm5483B2RV77 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm5483B2RV77 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm5483B2RV77 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gm5483B2RV77 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm5483B2RV77 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm5483B2RV77 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm5483B2RV77 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm5483B2RV77 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm5483B2RV77 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm5483B2RV77 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm5483B2RV77 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm5483B2RV77 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm5483B2RV77 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm5483B2RV77 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm5483B2RV77 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm5483B2RV77 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm5483B2RV77 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm5483B2RV77 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm5483B2RV77 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm5483B2RV77 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm5483B2RV77 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm5483B2RV77 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm5483B2RV77 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm5483B2RV77 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gm5483B2RV77 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gm5483B2RV77 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm5483B2RV77 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Gm5483B2RV77 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm5483B2RV77 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm5483B2RV77 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm5483B2RV77 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm5483B2RV77 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm5483B2RV77 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm5483B2RV77 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm5483B2RV77 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm5483B2RV77 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm5483B2RV77 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm5483B2RV77 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm5483B2RV77 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm5483B2RV77 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm5483B2RV77 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gm5483B2RV77 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gm5483B2RV77 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm5483B2RV77 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm5483B2RV77 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm5483B2RV77 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm5483B2RV77 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm5483B2RV77 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm5483B2RV77 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm5483B2RV77 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms