Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
1700042G07RikB1AUF7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
1700042G07RikB1AUF7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
1700042G07RikB1AUF7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
1700042G07RikB1AUF7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700042G07RikB1AUF7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
1700042G07RikB1AUF7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
1700042G07RikB1AUF7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
1700042G07RikB1AUF7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
1700042G07RikB1AUF7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
1700042G07RikB1AUF7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700042G07RikB1AUF7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700042G07RikB1AUF7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700042G07RikB1AUF7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700042G07RikB1AUF7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700042G07RikB1AUF7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700042G07RikB1AUF7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700042G07RikB1AUF7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700042G07RikB1AUF7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700042G07RikB1AUF7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
1700042G07RikB1AUF7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700042G07RikB1AUF7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700042G07RikB1AUF7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700042G07RikB1AUF7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
1700042G07RikB1AUF7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
1700042G07RikB1AUF7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
1700042G07RikB1AUF7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700042G07RikB1AUF7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700042G07RikB1AUF7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700042G07RikB1AUF7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700042G07RikB1AUF7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700042G07RikB1AUF7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700042G07RikB1AUF7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700042G07RikB1AUF7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700042G07RikB1AUF7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700042G07RikB1AUF7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700042G07RikB1AUF7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700042G07RikB1AUF7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700042G07RikB1AUF7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700042G07RikB1AUF7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700042G07RikB1AUF7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700042G07RikB1AUF7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700042G07RikB1AUF7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700042G07RikB1AUF7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700042G07RikB1AUF7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700042G07RikB1AUF7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700042G07RikB1AUF7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700042G07RikB1AUF7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700042G07RikB1AUF7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700042G07RikB1AUF7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700042G07RikB1AUF7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700042G07RikB1AUF7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
1700042G07RikB1AUF7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
1700042G07RikB1AUF7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700042G07RikB1AUF7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700042G07RikB1AUF7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700042G07RikB1AUF7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700042G07RikB1AUF7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700042G07RikB1AUF7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700042G07RikB1AUF7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700042G07RikB1AUF7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700042G07RikB1AUF7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700042G07RikB1AUF7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700042G07RikB1AUF7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700042G07RikB1AUF7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700042G07RikB1AUF7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
1700042G07RikB1AUF7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
1700042G07RikB1AUF7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
1700042G07RikB1AUF7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700042G07RikB1AUF7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700042G07RikB1AUF7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700042G07RikB1AUF7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700042G07RikB1AUF7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700042G07RikB1AUF7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
1700042G07RikB1AUF7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700042G07RikB1AUF7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700042G07RikB1AUF7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700042G07RikB1AUF7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700042G07RikB1AUF7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700042G07RikB1AUF7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700042G07RikB1AUF7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700042G07RikB1AUF7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
1700042G07RikB1AUF7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700042G07RikB1AUF7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700042G07RikB1AUF7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700042G07RikB1AUF7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700042G07RikB1AUF7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
1700042G07RikB1AUF7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700042G07RikB1AUF7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700042G07RikB1AUF7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
1700042G07RikB1AUF7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700042G07RikB1AUF7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
1700042G07RikB1AUF7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700042G07RikB1AUF7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700042G07RikB1AUF7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700042G07RikB1AUF7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700042G07RikB1AUF7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700042G07RikB1AUF7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700042G07RikB1AUF7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
1700042G07RikB1AUF7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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