Protein–RNA interactions for Protein: A2AB59

Arhgap27, Rho GTPase-activating protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap27A2AB59 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Arhgap27A2AB59 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Arhgap27A2AB59 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Arhgap27A2AB59 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Arhgap27A2AB59 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Arhgap27A2AB59 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Arhgap27A2AB59 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC44.97■■■■■ 4.79
Arhgap27A2AB59 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Arhgap27A2AB59 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Arhgap27A2AB59 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Arhgap27A2AB59 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
Arhgap27A2AB59 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Arhgap27A2AB59 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
Arhgap27A2AB59 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Arhgap27A2AB59 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Arhgap27A2AB59 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Arhgap27A2AB59 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Arhgap27A2AB59 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC44.68■■■■■ 4.74
Arhgap27A2AB59 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Arhgap27A2AB59 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
Arhgap27A2AB59 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Arhgap27A2AB59 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
Arhgap27A2AB59 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
Arhgap27A2AB59 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC44.49■■■■■ 4.71
Arhgap27A2AB59 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Arhgap27A2AB59 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Arhgap27A2AB59 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
Arhgap27A2AB59 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
Arhgap27A2AB59 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
Arhgap27A2AB59 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Arhgap27A2AB59 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Arhgap27A2AB59 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Arhgap27A2AB59 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC44.18■■■■■ 4.66
Arhgap27A2AB59 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
Arhgap27A2AB59 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Arhgap27A2AB59 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
Arhgap27A2AB59 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Arhgap27A2AB59 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Arhgap27A2AB59 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Arhgap27A2AB59 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Arhgap27A2AB59 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Arhgap27A2AB59 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
Arhgap27A2AB59 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC44.05■■■■■ 4.64
Arhgap27A2AB59 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Arhgap27A2AB59 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
Arhgap27A2AB59 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
Arhgap27A2AB59 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC43.82■■■■■ 4.61
Arhgap27A2AB59 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Arhgap27A2AB59 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Arhgap27A2AB59 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Arhgap27A2AB59 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
Arhgap27A2AB59 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Arhgap27A2AB59 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Arhgap27A2AB59 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
Arhgap27A2AB59 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Arhgap27A2AB59 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Arhgap27A2AB59 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC43.63■■■■■ 4.57
Arhgap27A2AB59 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
Arhgap27A2AB59 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Arhgap27A2AB59 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC43.61■■■■■ 4.57
Arhgap27A2AB59 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
Arhgap27A2AB59 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
Arhgap27A2AB59 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
Arhgap27A2AB59 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Arhgap27A2AB59 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
Arhgap27A2AB59 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Arhgap27A2AB59 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
Arhgap27A2AB59 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Arhgap27A2AB59 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Arhgap27A2AB59 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Arhgap27A2AB59 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Arhgap27A2AB59 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Arhgap27A2AB59 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.53
Arhgap27A2AB59 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Arhgap27A2AB59 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Arhgap27A2AB59 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
Arhgap27A2AB59 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Arhgap27A2AB59 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Arhgap27A2AB59 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Arhgap27A2AB59 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
Arhgap27A2AB59 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Arhgap27A2AB59 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
Arhgap27A2AB59 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Arhgap27A2AB59 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
Arhgap27A2AB59 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Arhgap27A2AB59 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
Arhgap27A2AB59 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Arhgap27A2AB59 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Arhgap27A2AB59 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Arhgap27A2AB59 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Arhgap27A2AB59 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
Arhgap27A2AB59 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Arhgap27A2AB59 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Arhgap27A2AB59 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Arhgap27A2AB59 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Arhgap27A2AB59 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
Arhgap27A2AB59 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Arhgap27A2AB59 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Arhgap27A2AB59 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Arhgap27A2AB59 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms