Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80eA0A0U1RP99 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80eA0A0U1RP99 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80eA0A0U1RP99 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ino80eA0A0U1RP99 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80eA0A0U1RP99 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80eA0A0U1RP99 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80eA0A0U1RP99 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80eA0A0U1RP99 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80eA0A0U1RP99 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80eA0A0U1RP99 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80eA0A0U1RP99 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80eA0A0U1RP99 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80eA0A0U1RP99 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80eA0A0U1RP99 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ino80eA0A0U1RP99 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80eA0A0U1RP99 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80eA0A0U1RP99 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80eA0A0U1RP99 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80eA0A0U1RP99 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Ino80eA0A0U1RP99 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ino80eA0A0U1RP99 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ino80eA0A0U1RP99 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80eA0A0U1RP99 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80eA0A0U1RP99 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ino80eA0A0U1RP99 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80eA0A0U1RP99 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80eA0A0U1RP99 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80eA0A0U1RP99 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80eA0A0U1RP99 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80eA0A0U1RP99 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80eA0A0U1RP99 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80eA0A0U1RP99 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80eA0A0U1RP99 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80eA0A0U1RP99 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80eA0A0U1RP99 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80eA0A0U1RP99 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80eA0A0U1RP99 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80eA0A0U1RP99 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80eA0A0U1RP99 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ino80eA0A0U1RP99 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ino80eA0A0U1RP99 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ino80eA0A0U1RP99 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ino80eA0A0U1RP99 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ino80eA0A0U1RP99 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ino80eA0A0U1RP99 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ino80eA0A0U1RP99 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ino80eA0A0U1RP99 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ino80eA0A0U1RP99 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ino80eA0A0U1RP99 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ino80eA0A0U1RP99 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ino80eA0A0U1RP99 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80eA0A0U1RP99 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80eA0A0U1RP99 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ino80eA0A0U1RP99 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80eA0A0U1RP99 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ino80eA0A0U1RP99 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ino80eA0A0U1RP99 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ino80eA0A0U1RP99 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ino80eA0A0U1RP99 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ino80eA0A0U1RP99 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ino80eA0A0U1RP99 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ino80eA0A0U1RP99 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ino80eA0A0U1RP99 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ino80eA0A0U1RP99 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ino80eA0A0U1RP99 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ino80eA0A0U1RP99 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ino80eA0A0U1RP99 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ino80eA0A0U1RP99 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ino80eA0A0U1RP99 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ino80eA0A0U1RP99 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ino80eA0A0U1RP99 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ino80eA0A0U1RP99 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ino80eA0A0U1RP99 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ino80eA0A0U1RP99 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ino80eA0A0U1RP99 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ino80eA0A0U1RP99 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ino80eA0A0U1RP99 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ino80eA0A0U1RP99 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ino80eA0A0U1RP99 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ino80eA0A0U1RP99 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ino80eA0A0U1RP99 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ino80eA0A0U1RP99 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms