Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q2

Ighv5-9, Immunoglobulin heavy variable 5-9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-9A0A075B5Q2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ighv5-9A0A075B5Q2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ighv5-9A0A075B5Q2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighv5-9A0A075B5Q2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ighv5-9A0A075B5Q2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ighv5-9A0A075B5Q2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ighv5-9A0A075B5Q2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ighv5-9A0A075B5Q2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ighv5-9A0A075B5Q2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ighv5-9A0A075B5Q2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ighv5-9A0A075B5Q2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighv5-9A0A075B5Q2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ighv5-9A0A075B5Q2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighv5-9A0A075B5Q2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighv5-9A0A075B5Q2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighv5-9A0A075B5Q2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ighv5-9A0A075B5Q2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighv5-9A0A075B5Q2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighv5-9A0A075B5Q2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv5-9A0A075B5Q2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighv5-9A0A075B5Q2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv5-9A0A075B5Q2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv5-9A0A075B5Q2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighv5-9A0A075B5Q2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighv5-9A0A075B5Q2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighv5-9A0A075B5Q2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighv5-9A0A075B5Q2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighv5-9A0A075B5Q2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ighv5-9A0A075B5Q2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighv5-9A0A075B5Q2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighv5-9A0A075B5Q2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighv5-9A0A075B5Q2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighv5-9A0A075B5Q2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighv5-9A0A075B5Q2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighv5-9A0A075B5Q2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ighv5-9A0A075B5Q2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ighv5-9A0A075B5Q2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ighv5-9A0A075B5Q2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ighv5-9A0A075B5Q2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ighv5-9A0A075B5Q2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ighv5-9A0A075B5Q2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighv5-9A0A075B5Q2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms