Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfkbiaQ9Z1E3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfkbiaQ9Z1E3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NfkbiaQ9Z1E3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms