Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cited4Q9WUL8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cited4Q9WUL8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cited4Q9WUL8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cited4Q9WUL8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cited4Q9WUL8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cited4Q9WUL8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cited4Q9WUL8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cited4Q9WUL8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cited4Q9WUL8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cited4Q9WUL8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cited4Q9WUL8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cited4Q9WUL8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cited4Q9WUL8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cited4Q9WUL8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms