Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dkc1Q9ESX5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms