Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8H7

Oma1, Metalloendopeptidase OMA1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oma1Q9D8H7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Oma1Q9D8H7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Oma1Q9D8H7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Oma1Q9D8H7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Oma1Q9D8H7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Oma1Q9D8H7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Oma1Q9D8H7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Oma1Q9D8H7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Oma1Q9D8H7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Oma1Q9D8H7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Oma1Q9D8H7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Oma1Q9D8H7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Oma1Q9D8H7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Oma1Q9D8H7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Oma1Q9D8H7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Oma1Q9D8H7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oma1Q9D8H7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms