Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zcchc13Q9D548 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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