Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan11Q9D1D1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan11Q9D1D1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan11Q9D1D1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms