Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99M08 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99M08 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99M08 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q99M08 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99M08 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99M08 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99M08 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99M08 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99M08 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99M08 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99M08 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99M08 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99M08 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99M08 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99M08 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99M08 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q99M08 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99M08 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99M08 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99M08 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99M08 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q99M08 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99M08 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99M08 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99M08 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99M08 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99M08 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99M08 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99M08 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99M08 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99M08 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q99M08 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q99M08 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q99M08 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q99M08 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q99M08 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q99M08 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q99M08 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q99M08 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q99M08 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q99M08 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q99M08 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q99M08 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q99M08 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q99M08 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q99M08 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q99M08 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q99M08 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q99M08 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q99M08 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q99M08 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q99M08 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q99M08 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q99M08 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q99M08 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q99M08 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q99M08 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q99M08 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q99M08 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q99M08 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q99M08 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q99M08 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q99M08 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q99M08 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q99M08 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q99M08 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q99M08 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q99M08 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99M08 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99M08 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99M08 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99M08 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99M08 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99M08 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99M08 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99M08 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99M08 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99M08 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99M08 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99M08 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99M08 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99M08 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99M08 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99M08 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99M08 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99M08 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99M08 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99M08 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99M08 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99M08 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99M08 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99M08 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99M08 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99M08 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99M08 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99M08 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99M08 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99M08 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99M08 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms