Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arrdc1Q99KN1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arrdc1Q99KN1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arrdc1Q99KN1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arrdc1Q99KN1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arrdc1Q99KN1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms