Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIJ6

Sfpq, Splicing factor, proline- and glutamine-rich, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfpqQ8VIJ6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SfpqQ8VIJ6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SfpqQ8VIJ6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SfpqQ8VIJ6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms