Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpap2Q8VC34 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpap2Q8VC34 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.9 ms