Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX0

4933402J07Rik, RIKEN cDNA 4933402J07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402J07RikQ8BHX0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933402J07RikQ8BHX0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933402J07RikQ8BHX0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms