Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2r2Q6ZWZ2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2r2Q6ZWZ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2r2Q6ZWZ2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2r2Q6ZWZ2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms