Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpbp1Q6NXH3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms