Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ca4Q64444 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ca4Q64444 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ca4Q64444 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ca4Q64444 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ca4Q64444 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ca4Q64444 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ca4Q64444 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ca4Q64444 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ca4Q64444 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms