Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ttf1Q62187 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ttf1Q62187 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Ttf1Q62187 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Ttf1Q62187 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttf1Q62187 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms