Protein–RNA interactions for Protein: Q61147

Cp, Ceruloplasmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpQ61147 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CpQ61147 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CpQ61147 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CpQ61147 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CpQ61147 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpQ61147 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpQ61147 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpQ61147 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpQ61147 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpQ61147 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CpQ61147 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpQ61147 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpQ61147 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpQ61147 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpQ61147 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpQ61147 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpQ61147 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpQ61147 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpQ61147 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpQ61147 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpQ61147 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CpQ61147 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpQ61147 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpQ61147 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpQ61147 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpQ61147 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpQ61147 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpQ61147 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpQ61147 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CpQ61147 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpQ61147 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpQ61147 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CpQ61147 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CpQ61147 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CpQ61147 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CpQ61147 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CpQ61147 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CpQ61147 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CpQ61147 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CpQ61147 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CpQ61147 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CpQ61147 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CpQ61147 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CpQ61147 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CpQ61147 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CpQ61147 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CpQ61147 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CpQ61147 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CpQ61147 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CpQ61147 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CpQ61147 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CpQ61147 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CpQ61147 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CpQ61147 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CpQ61147 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CpQ61147 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CpQ61147 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CpQ61147 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CpQ61147 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CpQ61147 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CpQ61147 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CpQ61147 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CpQ61147 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CpQ61147 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CpQ61147 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CpQ61147 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CpQ61147 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CpQ61147 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CpQ61147 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CpQ61147 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CpQ61147 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CpQ61147 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CpQ61147 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CpQ61147 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CpQ61147 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CpQ61147 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CpQ61147 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CpQ61147 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CpQ61147 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CpQ61147 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CpQ61147 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CpQ61147 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CpQ61147 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CpQ61147 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CpQ61147 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CpQ61147 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CpQ61147 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CpQ61147 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CpQ61147 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CpQ61147 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CpQ61147 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CpQ61147 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CpQ61147 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CpQ61147 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CpQ61147 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CpQ61147 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CpQ61147 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CpQ61147 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CpQ61147 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CpQ61147 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms