Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc27a1Q60714 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc27a1Q60714 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc27a1Q60714 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms