Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C87499Q3UX49 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C87499Q3UX49 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C87499Q3UX49 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms