Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RubcnlQ3TD16 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RubcnlQ3TD16 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RubcnlQ3TD16 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RubcnlQ3TD16 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms