Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx1P80205 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otx1P80205 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx1P80205 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx1P80205 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx1P80205 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otx1P80205 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otx1P80205 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms