Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf1P61148 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf1P61148 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgf1P61148 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms