Protein–RNA interactions for Protein: P54227

Stmn1, Stathmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn1P54227 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stmn1P54227 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stmn1P54227 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms