Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpl13P47963 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpl13P47963 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl13P47963 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl13P47963 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms