Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Me1P06801 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Me1P06801 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Me1P06801 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Me1P06801 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Me1P06801 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Me1P06801 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Me1P06801 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Me1P06801 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Me1P06801 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Me1P06801 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Me1P06801 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Me1P06801 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Me1P06801 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Me1P06801 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Me1P06801 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Me1P06801 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Me1P06801 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Me1P06801 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Me1P06801 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Me1P06801 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Me1P06801 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Me1P06801 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Me1P06801 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Me1P06801 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Me1P06801 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Me1P06801 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Me1P06801 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Me1P06801 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Me1P06801 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Me1P06801 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Me1P06801 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Me1P06801 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Me1P06801 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Me1P06801 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Me1P06801 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Me1P06801 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Me1P06801 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Me1P06801 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Me1P06801 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Me1P06801 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Me1P06801 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Me1P06801 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Me1P06801 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Me1P06801 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Me1P06801 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Me1P06801 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Me1P06801 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Me1P06801 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Me1P06801 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Me1P06801 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Me1P06801 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Me1P06801 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Me1P06801 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Me1P06801 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Me1P06801 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Me1P06801 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me1P06801 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me1P06801 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me1P06801 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me1P06801 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me1P06801 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me1P06801 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Me1P06801 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Me1P06801 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Me1P06801 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Me1P06801 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Me1P06801 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Me1P06801 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Me1P06801 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Me1P06801 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Me1P06801 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Me1P06801 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Me1P06801 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Me1P06801 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Me1P06801 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Me1P06801 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Me1P06801 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Me1P06801 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Me1P06801 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Me1P06801 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Me1P06801 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Me1P06801 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Me1P06801 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Me1P06801 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Me1P06801 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Me1P06801 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Me1P06801 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Me1P06801 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Me1P06801 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Me1P06801 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Me1P06801 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Me1P06801 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Me1P06801 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Me1P06801 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Me1P06801 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Me1P06801 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Me1P06801 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Me1P06801 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Me1P06801 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms