Protein–RNA interactions for Protein: J3QK27

Gm21693, Predicted gene, 21693, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21693J3QK27 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21693J3QK27 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21693J3QK27 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21693J3QK27 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21693J3QK27 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21693J3QK27 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms