Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Krt90E9Q1Z0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Krt90E9Q1Z0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Krt90E9Q1Z0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Krt90E9Q1Z0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt90E9Q1Z0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Krt90E9Q1Z0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt90E9Q1Z0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms