Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap3aB1AWZ3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms