Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttll9A2APC3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttll9A2APC3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms